fa تغییرات نوکلئوتیدی توالی ژن کدکننده پروتئین چند عملکردی X در فرد مبتلا به ویروس هپاتیت B ویروس شناسی Virology تحقيقي Original Articles <h1 dir="RTL" style="margin-top:0cm;margin-right:14.15pt;margin-bottom:0cm;margin-left:14.2pt;margin-bottom:.0001pt;page-break-after:auto;"><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;">زمینه و هدف : عفونت مزمن با ویروس هپاتیت </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">B</span></span></span></span> <span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">(HBV)</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> یکی از عوامل اصلی در ایجاد سیروز و سرطان سلول کبدی است. بیماری‌زایی ویروس به‌وسیله پروتئین چندعملکردی </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">x</span></span></span></span> <span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">(HBx)</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> صورت می‌گیرد. تغییر در توالی ژن کدکننده این پروتئین باعث تنظیم فاکتورهای نسخه‌برداری و بیماری‌زایی می‌شود. این مطالعه به منظور آنالیز ژنتیک تکاملی ژن کدکننده </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">HBx</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> در فرد مبتلا به </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">HBV</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> مزمن انجام شد.</span></span></span></span></h1> <h1 dir="RTL" style="margin-top:0cm;margin-right:14.15pt;margin-bottom:0cm;margin-left:14.2pt;margin-bottom:.0001pt;page-break-after:auto;"><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;">روش بررسی : در این مطالعه توصیفی آزمایشگاهی ابتدا از فرد آلوده به عفونت مزمن با ویروس هپاتیت </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">B</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> توالی کامل کدکننده </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">HBx</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> تکثیر و کلون شد. سپس <a name="OLE_LINK4"></a><a name="OLE_LINK3">با توالی‌های مرجع ژنوتیپ‌ها، سروتیپ‌ها و زیرسروتیپ‌های مختلف ویروس موجود در پایگاه </a></span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">GenBank</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;">، همردیفی توسط نرم‌افزار </span></span></span></span><a name="OLE_LINK2"></a><a name="OLE_LINK1"><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">CLC Sequence Viewer</span></span></span></span></a><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> انجام شد. از نتیجه هم‌ردیفی برای رسم درخت فیلوژنیک توسط سرور </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">T-rex</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> و آنالیز ژنتیک جمعیت توسط نرم‌افزار </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">DnaSP</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> استفاده شد. انتخاب طبیعی در سطح نوکلئوتید و پروتئین توسط تست </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Tajima&rsquo;s D</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> انجام گردید.</span></span></span></span></h1> <h1 dir="RTL" style="margin-top:0cm;margin-right:14.15pt;margin-bottom:0cm;margin-left:14.2pt;margin-bottom:.0001pt;page-break-after:auto;"><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;">یافته‌ها : جهش شناخته شده‌ای در سطح پروتئین در توالی کدکننده </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">HBx</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> فرد آلوده مزمن یافت نشد. نتایج انتخاب طبیعی نشان‌دهنده جهش‌های خنثی در ژن </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">HBx</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> بود. نتایج فیلوژنی نشان داد توالی کدکننده </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">HBx</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> در فرد آلوده مزمن قرابت ژنتیکی به ژنوتیپ </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">D</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> و زیرسروتیپ </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">ayw2</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> داشت.</span></span></span></span></h1> <h1 dir="RTL" style="margin-top:0cm;margin-right:14.15pt;margin-bottom:0cm;margin-left:14.2pt;margin-bottom:.0001pt;page-break-after:auto;"><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;">نتیجه‌گیری : چندریختی انتخاب طبیعی در ژن کدکننده </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">HBx</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> رخ می‌دهد. همچنین نتیجه فیلوژنی مطالعه حاضر با یافته‌های پیشین استان گلستان و ایران که فراوانی ژنوتیپ </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">D</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> و زیرسروتیپ </span></span></span></span><span dir="LTR" style="layout-grid-mode:line;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">ayw2</span></span></span></span><span style="layout-grid-mode:line;font-weight:normal;"><span style="color:windowtext;"><span style="font-family:tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> را گزارش داده‌اند؛ مطابقت دارد.</span></span></span></span></h1> <strong>Background and Objective: </strong>Chronic infection with Hepatitis B virus (HBV) is one of the main causes of cirrhosis and hepatocellular carcinoma (HCC). The pathogenicity of the virus is determined by the multi-functional protein x (HBx). Changing the sequence of the gene encoding this protein causes the regulation of transcription and pathogenicity factors. This study was done to analyze the genetic dynamics of the HBx coding gene in a person with chronic HBV.<br> <strong>Methods: </strong>In this descriptive laboratory study, an infected person with chronic hepatitis B virus infection was first amplified and cloned into complete sequence of HBx encoder. Then, the reference sequences of genotypes, serotypes and different virus subtypes of the GenBank database were matched by CLC Sequence Viewer software. The comparative result was used to plot the phylogenic tree by T-rex server and population genetic analysis using DnaSP software. Natural selection at the nucleotide and protein level was performed by the Tajima&#39;s D test.<br> <strong>Results: </strong>No known mutation at the level of the protein was found in the chronic sequence of the HBx encoder. The results of natural selection indicated neutral mutations in the HBx gene. The phylogenetic results showed that the HBx encoding sequences in the chronic infected individual had a genetic affinity with genotype D and ayw2 subtype.<br> <strong>Conclusion:</strong> Neutrality polymorphism takes place in HBx coding region. Also, the phylogenetic results of the present study are consistent with the previous findings of Golestan province and Iran which have reported the prevalence of genotype D and subspecies ayw2. ویروس هپاتیت B پروتئین چندعملکردی x , ژنتیک جمعیت , DnaSP , ژنوتیپ D , سروتیپ ayw2 Hepatitis B virus, HBx, Population genetics, DnaSP, Genotype D, Serotype ayw2 105 110 http://goums.ac.ir/journal/browse.php?a_code=A-10-1-1000&slc_lang=fa&sid=1 A Mohebbi علیرضا محبی 5900319475328460049409 5900319475328460049409 No M.Sc Student in Virology, Student Research Committee, Golstan University of Medical Sciences, Gorgan, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد ویروس شناسی پزشکی، کمیته تحقیقات دانشجویی دانشگاه، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران A Shakeri-Moghaddam علی شاکری مقدم 5900319475328460049410 5900319475328460049410 No M.Sc Student in Microbiology, Student Research Committee, Golstan University of Medical Sciences, Gorgan, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد میکروب شناسی، کمیته تحقیقات دانشجویی دانشگاه، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران Y Doudazndegan یوسف دوزندگان 5900319475328460049411 5900319475328460049411 No M.Sc Student in Virology, Student Research Committee, Golstan University of Medical Sciences, Gorgan, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد ویروس شناسی پزشکی، کمیته تحقیقات دانشجویی دانشگاه، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران N Lorestani نازنین لرستانی 5900319475328460049412 5900319475328460049412 No M.Sc Student in Virology, Student Research Committee, Golstan University of Medical Sciences, Gorgan, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد ویروس شناسی پزشکی، کمیته تحقیقات دانشجویی دانشگاه، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران A Mir-Arab اعظم میرعرب 5900319475328460049413 5900319475328460049413 No M.Sc Student in Virology, Student Research Committee, Golstan University of Medical Sciences, Gorgan, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد ویروس شناسی پزشکی، کمیته تحقیقات دانشجویی دانشگاه، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران AV Moradi عبدالوهاب مرادی 5900319475328460049414 5900319475328460049414 No Professor, Infectious Diseases Research Center, Golstan University of Medical Sciences, Gorgan, Iran استاد، مرکز تحقیقات بیماری‌های عفونی، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران A Tabarraei علیجان تبرایی tabarraei@goums.ac.ir 5900319475328460049415 5900319475328460049415 Yes Associate Professor, Infectious Diseases Research Center, Golstan University of Medical Sciences, Gorgan, Iran دانشیار، مرکز تحقیقات بیماری‌های عفونی، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران